Fue el Cardenal Arzobispo de Sevilla D.Fernando Niño de Guevara el que en 1604 por decreto regulo las procesiones de disciplinantes evitando desordenes publicos y ordenando que todas las penitencias tenian que hacer estación en la Catedral con lo que se dice que fue en el Arzobispado cuando se vio por primera vez un periodo de organizacion de las cofradias de penitencia en Cádiz

Durante varios años con la prohibicion de que los penitentes pudieran llevar antifaz y tunica peligro la semana mayor pero con el paso del tiempo esto cambio y se volvieron a usar.

El Rey Carlos III por decreto de 20 de febrero de 1777, prohibio todo tipo de penitencia y mortificacion publica( los disciplinantes, empalados etc...), tambien prohibio las procesiones nocturnas, solo pudiendo llevarse acabo de diay organizadas como ahora lo hacen en la semana mayor.

Hasta estos tiempos las cofradias dependieron unicamente de la iglesia debiendose hacer las regalias de la Corona ostensibles en la ordenacion de las cofradias.